Итак, путем поиска света в тернях конфы было найдено и реализованно следующие:
1. В ММ обработки ОбеспечениеПотребностей есть функция "ВыполнитьОбеспечениеЗаказа(Заказ, ИндексыСтрок, ПереченьВариантов)". Эта функция как раз делает то, что нам нужно без использования типов клиента(даныееФормыСтруктура и пр.)
2. Эта функция не экспортная, так как используется только другими методами в этом модуле. Поэтому добаляем обработку в расширение. И добавляем экспортный метод который будет вызывать нужный нам метод.
Функция ВыполнитьОбеспечениеЗаказаЭкспорт(Заказ, ИндексыСтрок, ПереченьВариантов) Экспорт
Возврат ВыполнитьОбеспечениеЗаказа(Заказ, ИндексыСтрок, ПереченьВариантов);
КонецФункции
3. Используем там где нам нужно. Передаем в этом экпортный метод ссылку на заказ, индексы строк ТЧ товары, а также нужные нам варианты обеспечения. В моём случае их два: СоСклада и Обособленно. нужно собственно для того, что бы строка разбивалась на две, если не хватает товара для резерва на остатках по складу.