![]() |
![]() |
![]() |
|
OFF: Помогаем изучать процессы сворачивания белков в проекте Folding@Home | ☑ | ||
---|---|---|---|---|
0
LarsVVS
12.10.08
✎
13:50
|
Цель проекта — изучение болезней. Изучаются заболевания, вызываемые дефектными белками: болезни Альцгеймера, Паркинсона, диабет типа II, коровье бешенство и склероз. Поняв, почему возникают дефекты в белках одного типа, ученые смогут выяснить, почему это происходит и с другими белками. Также изучаются генетические заболевания: несовершенный остогенезис(остеопсатироз), муковисцидоз, болезнь Хантингтона.
---------- Описание проекта - http://distributed.ru/?pro.fah ФАК на русском - http://distributed.ru/wiki/pro:fah:faq Официальный сайт - http://folding.stanford.edu/ (http://distributed.ru/folding/ - перевод) Страница для скачивания - http://folding.stanford.edu/download.html (здесь же можно проверить наличие Вашего ника в проекте!!!) Высокопроизводительные клиенты (для видеокарт и многопроцессорных/многоядерных систем) - http://folding.stanford.edu/English/DownloadWinOther Страница команды - http://vvs.izhevsk.net/1C-Community/ ---------- Наша команда: 1C-Community, номер - 47240 ---------- В двух предыдущих проектах MD@Home и Find-a-Drug наша команда заняла соответственно первое и 16-е место. ---------- Присоединяйтесь! Клиент прост в установке и использовании, работает в наинизшем приоритете, и практически не мешает другим приложениям. Предыдущая ветка по теме: OFF: Ищем ошибки в сворачивании белков (Folding@Home) |
|||
1
LarsVVS
12.10.08
✎
13:56
|
Скорость команды достигла 150 тысяч очков в неделю. Из них более 98 тысяч - на счету двух участников: Bozman и ShoGUN.
BlackMak - ты кажется грозился подключить десяток не самых слабых процессоров? Пока не заметно ;) Команда вышла на 351-е место в общем зачёте и на 271-е по недельной скорости. |
|||
2
Преемник
12.10.08
✎
15:46
|
на кого работаем?
|
|||
3
Коллайдер
12.10.08
✎
15:48
|
> Цель проекта — изучение болезней
это версия для лохов беспоатно работающих на какого-то аспиранта. |
|||
4
ShoGUN
12.10.08
✎
15:51
|
Не спасут десятки процессоров. Видюхи считают в десятки раз быстрее квадов. Все что я набрал - насчитано на домашней GeForce 8800GT и на рабочей GeForce 8600GT.
|
|||
5
Bender_
АцкийРобот 13.10.08
✎
10:40
|
пожалуй присоединюсь, видюха мощняцкая 8800GTS альфадог разогнанная простаивает, может че и насчитаем...
|
|||
6
LarsVVS
14.10.08
✎
09:23
|
(4)Считают - да, но очки и на квадах можно вполне приличные получать. Зависит от графика работы системы и количества процессоров :) На оверклокерах выкладывали результат - более 14 тысяч очков в сутки с 4-процессорной системы с 4-ядерными Оптеронами.
|
|||
9
Adoff
14.10.08
✎
09:37
|
(0) и хренли ты мои сообщения удалил, типа если модератор спамит, то это уже не спам?
|
|||
10
LarsVVS
14.10.08
✎
09:42
|
(9)То же самое, но человеческим языком можно было сказать.
|
|||
12
Adoff
14.10.08
✎
09:47
|
(10) спамер, на тебя тоже управа найдется
|
|||
13
LarsVVS
14.10.08
✎
09:49
|
(12) Предлагаю изучить вопрос вначале
|
|||
14
LarsVVS
28.10.08
✎
16:51
|
У нас новый участник(правда уже почти месяц как новый :) ) - Bender_AckiRobot
|
|||
15
Bender_
АцкийРобот 28.10.08
✎
16:58
|
(14) че то заметил что видеокарту колбасит неподецки, нагружает на 100%, после часа расчетов раскаленная...поэтому целый день гонять боязно...буду по часу в день...
|
|||
16
Kerk
28.10.08
✎
17:46
|
А для ATI редеонов ничего не придумали для расчета сабжа?...
|
|||
17
LarsVVS
28.10.08
✎
19:01
|
(15)Главное успевай задание выполнить до конца deadline.
Для большинства задач под GPU deadline всего 3 дня. (16)http://folding.stanford.edu/English/DownloadWinOther Windows: V6 GPU2 (ATI 2xxx, 3xxx, 4xxx, nVidia) clients Для более младших карт - ничего нет. |
|||
18
Bozman
28.10.08
✎
19:34
|
(15) У меня 8800GTS 640Mb от EVGA (слегка разогнанная) с небольшими перерывами на СТАЛКЕРа уже второй месяц не выключаясь работает. Пока полет нормальный.
|
|||
19
Bozman
28.10.08
✎
19:35
|
(15) Температура не выше 70. Тот же СТАЛКЕР прогревает ее до 80.
|
|||
20
Bozman
03.11.08
✎
12:39
|
Ну, вот. СМП 5.92 свое отработал. Так, что пока не придумаю чем заменить придется сбавить обороты.
|
|||
21
ildus
03.11.08
✎
13:04
|
а за это платят?
|
|||
22
Bozman
03.11.08
✎
13:21
|
(21) Нет. Считать можно бесплатно.
|
|||
23
Bozman
05.11.08
✎
12:27
|
LarsVVS. Чтобы сейчас запустить smp-5.92 нужно только поставить на компьютере дату до 2 ноября и он запустится. Потом можно вtрнуть правильную дату и пока клиент не остановлен он будет нормально считать, отправлять и принимать жабы. Хотя я и не понимаю зачем было закрывать клиента работающего на Win2K, можно подумать уже все отказались от неё.
|
|||
24
Kerk
05.11.08
✎
12:59
|
(17) Жаль, а то 8000 серии ATI, помог бы...
|
|||
25
LarsVVS
05.11.08
✎
13:08
|
(24)У меня самого GF-6600 простаивает... как и домашний A64-X2 - не успевает SMP-клиент при моём режиме работы на компе закончить задание до дедлайна. Поэтому стоит обычный клиент...
(23)Спасибо, хоть у меня и нет F@h на W2k, но одна 5.91 ещё стояла... Заменил её на 6.22... |
|||
26
Naumov
05.11.08
✎
13:09
|
(24) так не обязательно на видео считать. на простом клиенте.
(23) SMP-клиент до сих пор в статусе бетты ходит, поэтому и дата использования ограничена. сейчас типа 6.хх предлагают пользовать. |
|||
27
Naumov
05.11.08
✎
13:10
|
(25) Так дома поставил бы обычные задания. их всяко успеет.
|
|||
28
LarsVVS
05.11.08
✎
13:10
|
(26) 6.хх не запускается на w2k
|
|||
29
LarsVVS
05.11.08
✎
13:11
|
(27)Так я и говорю "стоит обычный клиент".
|
|||
30
Bozman
05.11.08
✎
13:49
|
У меня на дома на XP smp-6.22 почему-то глючит. При запущенном 5.92 спокойно работаю, а на 6.22 непредсказуемо BSOD и перезагрузка.
|
|||
31
Преемник
05.11.08
✎
17:34
|
...продолжаем работать на пиндоскую оборонку
|
|||
32
Bozman
05.11.08
✎
21:40
|
Если кому актуально - продленный клиент СМП 5.92 здесь: http://www.stanford.edu/~kasson/folding/windows/fah-SMP-592.exe
Там же есть и 5.91. На сколько продлили пока не знаю. |
|||
33
LarsVVS
08.11.08
✎
21:22
|
Оказывается есть версия 6.23, в которой разработчики постарались исправить проблемы, вызывающие ошибку "early unit end"
Ссылки здесь: http://foldingforum.org/viewtopic.php?f=24&t=6142 |
|||
34
LarsVVS
13.11.08
✎
16:45
|
А у нас новичёк - Sonny. И он уже успел развить очень неплохую скорость...
|
|||
35
LarsVVS
01.12.08
✎
22:07
|
Оказывается выложены новые версии клиентов (6.23) для одноядерных процессоров http://folding.stanford.edu/English/Download и для видеокарт http://folding.stanford.edu/English/DownloadWinOther
|
|||
36
Sonny
01.12.08
✎
23:22
|
(34) Юзаю клиент для видеокарты. Багов почти не замечено, только иногда виснет IE при серфинге страничек с флеш-анимацией.
|
|||
37
LarsVVS
17.12.08
✎
13:56
|
Организаторы очень рекомендуют тем, кто использует GPU клиент на картах ATI/AMD, обновить его со страницы http://www.stanford.edu/group/pandegroup/folding/special/DownloadATI.html Сообщается о исправлении ошибок и увеличении производительности. Тем, кто запускает GPU клиент на картах NVidia так же рекомендуют обновиться - исправлены некоторые ошибки: http://folding.stanford.edu/English/DownloadWinOther
|
|||
38
Megas
17.12.08
✎
14:03
|
============
Экзамен по биологии сидят студенты один студент грузин(г) с задумчивым лицом спрашивает у соседа(с) Г:Слушай, что такое "бЕлка" ? С:Ну знаеш такой маленький пушистый зверёк, бегает, прыгает по деревьям , ещё орешки грызёт.. Проходит ещё пол часа! Г:Слушай а что такое тогда "Синтез бЕлка"? |
|||
39
LarsVVS
18.12.08
✎
15:44
|
Командой взят рубеж в 7 миллионов очков. Последние 2 миллиона добыты менее чем за 4 месяца!
Сейчас команда находится на 340-м месте по общему количеству очков и на 346 по скорости за неделю. |
|||
40
LarsVVS
24.12.08
✎
08:59
|
_UP_ - новый участник в команде!
Лидер команды, Bozman набрал уже 2 миллиона очков! Остальные "старички" команды с августа взяли следующие рубежи: ShoGUN - 250 тысяч очков vega - 250 тысяч очков kolys - 250 тысяч очков GROOVY - 100 тысяч очков Badger2007 - 100 тысяч очков Perec - 100 тысяч очков Sonny - 50 тысяч очков ptiz - 50 тысяч очков Soda - 50 тысяч очков mishaPH - 25 тысяч очков zlodey - 25 тысяч очков Arcanist - 10 тысяч очков DenisCh - 10 тысяч очков tbreaker - 10 тысяч очков mamont - 5 тысяч очков Qvz - 5 тысяч очков Bender AckiRobot - 5 тысяч очков MoriQwendi - 5 тысяч очков Seregan - 5 тысяч очков Idos - 5 тысяч очков Doomer - 2500 очков dim ru - 1000 очков SergMiller - 1000 очков |
|||
41
LarsVVS
24.12.08
✎
09:49
|
Разработчики видимо под конец года выпустили несколько статей. Начну потихоньку переводить их...
http://folding.typepad.com/news/2008/12/long-term-vision-for-fah-science-clients-etc.html Долгосрочные перспективы проекта: наука, клиенты и прочее В первые годы проекта было сделано многое для создания методологии (оригинальные алгоритмы распределенных вычислений, проверка методов), в последние годы шла работа по использованию видеокарт, PlayStation3, и многопроцессорных платформ. Кроме того было и много работы, прямо относящейся к болезням и здоровью человека. Доноры увидят результаты этих работ в ближайшее время. В частности, результаты по болезни Альцгеймера, болезни Хантингтона, а также некоторые другие сюрпризы (некоторые детали лучше оставить до публикаций). С точки зрения перспектив программное обеспечения FAH, наша краткосрочная цель состоит в улучшении работы SMP клиента. Сейчас идут работы над клиентом SMP2, который будет лучше, чем текущий точно так же, как клиент GPU2 много лучше, чем GPU1 (проще в использовании, требует меньше усилий доноров, и гораздо лучше масштабируется). Это улучшение - сочетание изменений в клиенте и (особенно важно) появления новых расчетных ядер. Эта работа продолжается уже около года, сделано достаточно много, так что можно говорить об этом публично. Также разрабатывается новое ПО для серверов проекта - для части из них новый код уже написан и идет постепенный переход на него, для остальных - также в планах написание кода "с нуля". В долгосрочной перспективе, со стабильными клиентами GPU2 и SMP2, мы сможем затем перейти к другим областям. Наша цель состоит в том, чтобы быть на переднем крае нашей науки, но и вернуться к простоте и стабильности классического клиента. У нас есть еще пути развития, но мы рады, что проекты, которые были начаты некоторое время назад, в скором времени увидят свет. |
|||
42
Naumov
24.12.08
✎
09:52
|
Ничего-ничего. Вроде пытаются замутить Отечественный проект.
|
|||
43
Bozman
24.12.08
✎
09:57
|
(42) Дай Бог. Пусть только замутят, тут мы и навалимся им в помощь.
|
|||
44
Bozman
24.12.08
✎
09:59
|
(42) Есть какая-нибудь достоверная инфа?
|
|||
45
АП
24.12.08
✎
10:01
|
(40) ку :)
|
|||
46
ДенисЧ
24.12.08
✎
10:02
|
(45) Ты тоже буржуЯм помогаешь? :-)
|
|||
47
АП
24.12.08
✎
10:04
|
(46) еще скажи, что пить со мной перестанешь )
|
|||
48
ДенисЧ
24.12.08
✎
10:06
|
(47) Не перестану, не надейся :-)
Просто думаю, когда и где оно у тебя крутится... |
|||
49
АП
24.12.08
✎
10:14
|
(48) ну думай-думай, глядишь и шапку купишь )
вариантов не много ) |
|||
50
Naumov
24.12.08
✎
10:21
|
(44) ну тут пока идет обсуждение http://distributed.ru/forum/index.php?a=topic&topic=1030
|
|||
51
LarsVVS
15.01.09
✎
09:30
|
В команде два новых участника: Kerk и FrostWind
|
|||
52
NDN
19.01.09
✎
15:28
|
FrostWind - это я
|
|||
53
smaharbA
19.01.09
✎
15:37
|
Эльниньо с AgaSoft на вас нету
OFF: ИМХО: - Пиндосы начали заражать людей ЧУМОЙ |
|||
54
smaharbA
19.01.09
✎
15:38
|
вот ведь влип AcaGost )))
|
|||
55
Kerk
19.01.09
✎
15:44
|
(52) Ну кто второй надеюсь труда понять не составит...
|
|||
56
LarsVVS
20.01.09
✎
10:56
|
http://folding.typepad.com/news/2008/12/foldinghome-alzheimers-simulation-work-published.html
Опубликована работа по моделированию болезни Альцгеймера в Folding@Home (документ № 58 на http://folding.stanford.edu/English/Papers) Предполагается, что нарушения в сборке и сворачивании белка Abeta являются причиной возникновения болезни Альцгеймера. Моделирование, например в Folding@Home, является путем для понимания этого процесса. Есть несколько ключевых проблем для имитации ключевого шага - олигомеризации. Эта работа представляет собой новый способ имитации олигомеризации Abeta с возможностью имитировать экспериментируя с соответствующими сроками и концентрациями, используя новый метод. Мы используем этот метод, и вычислительные мощности, предоставленную донорами Folding@Home для имитации олигомеризации в мельчайших подробностях. Это позволит получить точные представления о процессе, которые мы в настоящее время получаем путем проведения экспериментов. Во многих отношениях этот документ является "вершиной айсберга" работы Folding@Home над болезнью Альцгеймера, гораздо больше интересных результатов ещё ожидается, особенно в плане экспериментальных подтверждений наших прогнозов и в новых возможностях для разработки новых лекарств и терапии болезни Альцгеймера. Итак, в то время как мы рады, что этот результат является в настоящее время прошлых коллегиального рассмотрения, мы еще больше рады, за то, что в ближайшие вниз трубопровод, ожидая оценки. Мы будем держать вас в курсе, делая результаты достоянием общественности, и, как мы надеемся, публиковать несколько даже больше объявлений в 2009 году. UPDATE: Был задан вопрос, какие клиенты участвовали в работе над проектом. Эта работа началась несколько лет назад и потребовалось некоторое время для анализа, а затем для публикации. Таким образом, проект выполнялся исключительно на классических клиентах. Для последующих расчетов, мы используем смесь GPU, SMP, и классических клиентов. Из-за большого числа классических клиентов, они позволяют нам расчеты, выполнение которых не представляется возможным на других платформах. Тем не менее, высокие скорости (но меньшее число) GPU и SMP клиентов позволяют нам получить приблизительные результаты быстро, уточняя потом их на классических клиентах. |
|||
57
Aswed
20.01.09
✎
11:01
|
Ну вытащили ветку)))
|
|||
58
Jump
20.01.09
✎
11:15
|
(0)Расход трафика какой?
|
|||
59
MMF
20.01.09
✎
11:39
|
(56) "мы еще больше рады, за то, что в ближайшие вниз трубопровод, ожидая оценки" - ничего себе
|
|||
60
LarsVVS
20.01.09
✎
16:38
|
(59)Прошу прощения. Проглядел. Данное предложение вообще не должно было попасть в перевод.
|
|||
61
LarsVVS
20.01.09
✎
16:55
|
(58)3 компьютера, SMP-клиенты, за 20 дней - менее 50 Мб входящего и несколько больше 300 Мб исходящего.
|
|||
62
Сержант 1С
21.01.09
✎
06:03
|
уже как за два года, по сию пору ниразу не было обозначено, кому, зачем и как мы помогаем вычислительными ресурсами.
а ну как работаем на натовскую оборонку? :) |
|||
63
Сержант 1С
21.01.09
✎
06:03
|
ну всякие слова говорились конечно, а вот результаты там, доказательства? (ромикс)
|
|||
64
LarsVVS
21.01.09
✎
08:15
|
(63)А какие нужны результаты и доказательства? Статьи в профильных научных журналах печатают тоже по протекции Пентагона/ЦРУ?
|
|||
65
Сержант 1С
21.01.09
✎
08:23
|
(64) в любой статье указываются методы и материалы до запятой...
|
|||
66
LarsVVS
21.01.09
✎
09:30
|
(65)Поясни
|
|||
67
LarsVVS
12.02.09
✎
09:03
|
Командой взят рубеж в 7 миллионов очков. Команда занимает 333-е место по общему количеству очков и 373-е по скорости за последнюю неделю.
|
|||
68
LarsVVS
12.02.09
✎
09:11
|
*8 миллионов
|
|||
69
LarsVVS
09.03.09
✎
06:35
|
По скорости команда вышла на 316 место...
|
Форум | Правила | Описание | Объявления | Секции | Поиск | Книга знаний | Вики-миста |