Что же так всех этот вопрос сильно волнует ? У меня комплекс неполноценности складывается, люди там пишут какие-то мегавещи, защищают их паролями, криптуют, охраняют по ночам ...а я ? ни одной защищенной, эксклюзивной разработки ((
По существу - не знаю, но сильно сомневаюсь, что программа, которая "sa" пароль от SQL сервера хранит в обычном текстовом файлике сможет защитить конфигурацию хоть сколько -нибудь достойным образом ...
Тут кто-то уже советовал выносить наиболее "креативные" куски кода во внешние dll